氏名 : 中川 裕規 (281267227)
所属 : 笹井研
題目 : 配列順序に依存しない構造関係性を用いたタンパク質立体構造予測新規手法開発
概要 :
背景
タンパク質の立体構造情報は創薬の場などで用いられる重要な情報である。タンパク質の立体構造予測の手法においては構造空間の探索が重要であるが、その全探索空間はあまりにも広すぎて、ターゲットのタンパク質の取りうる全構造を現実的な時間で探索し切ることはほぼ不可能である。故に、効率的な構造探索を行う必要がある。
その構造空間に関する研究として近年、あるタンパク質に対して構造が似ている他のタンパク質が存在する確率が、配列順序を考慮する場合としない場合とでは、後者は前者の約3倍高くなることが報告された(南、2011)。
本研究の目的
配列順序を無視した既存のタンパク質をテンプレートとして構造を予測したいタンパク質(ターゲット)を探索し、実際の構造に近い構造を作ることを目的とする。
発表内容
提案手法によるベンチマークテストの結果と、それに基づいた考察を述べる。
目次に戻る