氏名 : 大谷 康郎 (281167028)
所属 : 美宅研
題目 : 分泌型タンパク質の分類予測
概要 :
我々の研究室では、2009年にSOSUImp1と呼ばれるタンパク質のアミノ酸配列のみ
から高い精度でタンパク質の分類予測を行うシステムが開発された。そのシ
ステムによりタンパク質は大きく分けて一本型膜貫通タンパク質、複数回膜貫通
型タンパク質、分泌型タンパク質、細胞質内型水溶性タンパク質に分類予測する
ことができる。
本研究では分泌型タンパク質の内のさらに成長因子と呼ばれるタンパク質の分類
予測を目的としている。成長因子は動物体内において、特定の細胞や文化を促進
する内因性タンパク質の総称であり、様々な細胞学的・生理学的過程の調節に働
いており、標的細胞の表面の受容体タンパク質に特異的に結合することにより、
細胞間の信号物質として働く。よって成長因子は疾患などに深い関係性があり、
本研究によって特徴や生物進化の過程での変化を調べることにより、疾患の解明
の手助けになると考えている。
研究手順は、初めにswissprotと呼ばれるタンパク質のデータベースからすべて
のタンパク質を抽出し、SOSUImp1に通し分泌型タンパク質に絞り込む。次にその
分泌型タンパク質のデータセットをアミノ酸残基数や疎水性、電荷などの物理的
側面からさらに成長因子に絞り込み、高い精度で予測できるようにする。
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