氏名 : 渡 信彦 (280467230)
所属 : 旧土井研
題目 : 壁面付近における希薄溶液中DNA分子のダイナミクス・シミュレーション
概要 :
バルク溶液中の高分子のダイナミクスに比べて、壁面付近のダイナミクスについてはあまりよく知られていない
。実験では、DNA分子希薄溶液に壁面と平行なずり速度が与えられた際、分子が壁から離れる方向に移動する現
象が観測されているが、そのメカニズムは未だ明らかではない。本研究は、壁面付近・ずり流動下で希薄溶液中
高分子のダイナミクスをシミュレーションすることによって、壁面がダイナミクスに与える効果を明らかにする
ことを目的とする。手法としては、高分子をバネ・ビーズモデルを用いて扱い、１つの平面壁の存在下で高分子
のブラウニアンダイナミクス・シミュレーションを行った。シミュレーションにあたり、溶液中の拡散テンソル
を壁面およびビーズ自身が存在することによる項（Hydrodynamic Interaction テンソル）を含めて定義・導入
し、シミュレーション結果として壁面からの距離に依存した高分子の濃度分布を得た。最後に、高分子としてDNA
λ-Phageをとりあげ、パラメータを設定してシミュレーションを行い、その結果を実験結果と比較することでモ
デルの妥当性を評価した。
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